Утилита rm встроенная в систему позволяет удалить как отдельный файл, так и отдельный каталог (папку).
Как удалить файл или папку на сервере VPS (Ubuntu) командой rm (remove)
Удаляем отдельный файл на сервере VPS (Ubuntu)
Удаляем один файл в определенном каталоге (в нашем случае файл file.html в каталоге html).
sudo rm /var/www/site.ru/html/file.html
Чтобы удалить несколько файлов нужно просто перечислить их через пробел.
sudo rm /var/www/site.ru/html/file-1.html file-2.html file-2.html
Если добавить опцию -i, необходимо будет подтвердить удаление.
sudo rm -i/var/www/site.ru/html/file.html
Удаляем папку на сервере VPS (Ubuntu)
sudo rm -r /var/www/site.ru/html/field
Еще статьи по серверу VPS
— Как посмотреть список пользователей на сервере VPS (Ubuntu)?